根据官方消息，2015年12月29日，深圳市报告了首例H5N6流感病例,这也是全球第5例的报告病例。2016年1月4日，据深圳市疾控中心消息，该患者因病情严重，已于2015年12月30日下午经抢救无效死亡。

据悉，该病例为女性患者吴某，26岁，家住宝安区，28日被定点医院收治住院。经过两天的用药和抢救，但最终因病情严重经抢救无效死亡。经过基因测序分析认为，该病例是因接触活禽或市场外环境感染的。

基因测序结果显示，患者样本中H5N6病毒HA、NA基因与2014年广东省从鸭只中分离的H5N6病毒高度同源，同源性>98%；与深圳2014年活禽市场外环境分离出的H5N6病毒高度同源，同源性>98%；与深圳2015年12月份来自外环境标本分离出的3株H5N6病毒高度同源。　　

同时，患者样本中H5N6病毒HA、NA基因与2014年四川和广东报告的2例H5N6流感病例的病毒高度同源，同源性>98%。患者样本中H5N6病毒的内部6个基因与本地外环境中H9N2病毒高度同源，H9N2病毒为该病毒的内部骨架供体。患者样本中H5N6病毒HA和NA基因分别来源于外环境中的H5N1病毒和H6N6病毒。　　

经过测序分析认为，目前深圳活禽市场外环境存在H5N6流感病毒。

此外，在新年第一天，2016年1月1日，同为广东省的肇庆市报告1例H5N6病例。患者何某，女，40岁，现住肇庆市端州区。目前患者病情较重，在肇庆市的定点医院隔离治疗。

病例发生后，肇庆市当即开展流行病学调查和采样检测工作，对有关场所进行消毒。对64名密切接触者和市场禽类5名从业人员进行医学观察及健康监测工作，有16名密切接触者解除医学观察，48人仍处于医学观察期内，目前，未出现身体不适情况。